🧾 국고보조금 관련 부가가치세법상 공통매입세액 안분계산 규정의문제점과 개선방안(Problems and Improvement Measures of the Apportionment Calculation Rules for Common Input Tax under the Value-Added Tax Act Related to Government Subsidies)―의정부지방법원 2012.6.26. 선고2011구합4010 판결 사안을 중심으로―)_2023_한국조세연구소_임현지, 강민조

[Original Paper(논문 원본)]

https://www.dbpia.co.kr/journal/articleDetail?nodeId=NODE11608175

[Paper Summary(논문 요약)]

Key Concepts(주요 개념)

■ Common Input Tax(공통매입세액)

Refers to input tax that is used commonly for both taxable and tax-exempt businesses, making it impossible to distinguish its actual attribution.(과세사업과 면세사업에 공통으로 사용되어 실지 귀속을 구분할 수 없는 매입세액을 의미함.)

■ Non-taxable Business(비과세사업)

Refers to a business that supplies goods or services that are not subject to value-added tax (VAT).(부가가치세가 과세되지 않는 재화 또는 용역을 공급하는 사업을 의미함.)

■ Government Subsidy(국고보조금)

Refers to subsidies received by a business entity from the government or similar authorities.(국가 등으로부터 사업자가 수령하는 보조금을 의미함.)

■ Supply Value for Tax-Exempt Businesses, etc.(면세사업등 공급가액)

the supply value of tax-exempt businesses, and government subsidies, public subsidies, and similar amounts that are received by the business in relation to such tax-exempt businesses but are not included in the tax base.(면세사업에 대한 공급가액과 사업자가 해당 면세사업과 관련하여 받았으나 과세표준에 포함되지 아니하는 국고보조금 및 공공보조금, 이와 유사한 금액의 합계액을 의미함.

1. Research Objective(연구 목적)

• The purpose is to analyze the problems of the current legal system under the Value-Added Tax Act, which treats government subsidies in the same manner as non-taxable and tax-exempt supply values when calculating the apportionment of common input tax.(부가가치세법상 공통매입세액 안분계산 시 국고보조금을 비과세·면세공급가액과 동일하게 취급하는 현행 법령체계의 문제점을 분석하는 것을 목적으로 함.)
• It aims to identify the legal and policy-related issues of the VAT framework that treats government subsidy receipts as equivalent to tax-exempt supply values, and to propose legislative improvements.(국고보조금 수령액을 면세공급가액과 동일하게 취급하는 부가가치세 법령체계의 법리적·정책적 문제점을 지적하고 입법개선안을 제시하는 것을 목적으로 함.)
• It also aims to analyze a case in which the issue arose as to whether government subsidies (operational grants) received by a non-profit organization conducting government-designated research and development services as its primary purpose business should be included in the apportionment calculation of common input tax.(국가가 지정하는 연구개발용역을 고유목적사업으로 수행하는 비영리법인이 수령하는 국고보조금(운영출연금)의 공통매입세액 안분계산 시 포함 여부가 쟁점이 된 사례를 분석하는 것을 목적으로 함.)

2. Research Methodology(연구 방법)

• The study provides an overview of the historical development of the apportionment rules for common input tax and reviews judicial precedents in which the apportionment of common input tax related to government subsidies was at issue.(공통매입세액 안분계산 규정의 연혁을 개관하고 국고보조금 관련 공통매입세액 안분계산이 쟁점이 된 판례를 검토함.)
• Based on an analysis of the relevant rulings, it compares the Korean Value-Added Tax Act with the EU VAT Directive regarding the tax treatment of government subsidies in the apportionment of common input tax.(쟁점 판결에 대한 분석을 바탕으로 공통매입세액 안분계산에 있어서 국가보조금의 세제상 취급에 대한 우리나라 부가가치세법과 EU 부가가치세지침을 비교함.)
• Focusing on the practical implications of the key rulings, it identifies problems in the current method of apportioning common input tax related to government subsidies and proposes improvement measures.(쟁점 판결의 실무적 시사점을 중심으로 국고보조금 관련 공통매입세액 안분계산 방식의 문제점을 지적하고 개선방안을 제시함.)

3. Key Findings(주요 연구 결과)

• Under the current Enforcement Decree of the Value-Added Tax Act, government subsidies are treated in the same manner as the supply value of tax-exempt businesses in the apportionment calculation of common input tax, regardless of whether they constitute consideration. As a result, input tax is disallowed in proportion to the amount of government subsidies, leading to the issue that the VAT burden ultimately falls on public-interest entities.(현행 부가가치세법 시행령은 국고보조금의 대가성 유무와 관계없이 공통매입세액 안분계산 시 면세사업공급가액과 동일하게 취급하여, 국고보조금 규모에 비례하여 공통매입세액이 불공제됨으로써 공익사업자에게 부가가치세 부담이 귀착되는 문제가 있음.)
• Treating government subsidies uniformly as tax-exempt supply values produces policy effects that contradict the original intent of providing such subsidies.(국고보조금을 일률적으로 면세공급가액과 같이 취급하는 것은 국고보조금 지원의 취지를 반하는 정책효과를 야기함.)
• Furthermore, the concept of the “supply value” of non-taxable businesses gives rise to a conceptual inconsistency, as it presupposes a supply within a business where no supply actually exists, thereby creating room to include the mere receipt of government subsidies within the supply value of non-taxable activities.(비과세사업의 공급가액이란 개념은 공급이 없는 사업의 공급가액이라는 개념적 모순에 직면하며, 국고보조금의 수령행위 자체를 비과세사업의 공급가액에 포함시킬 수 있는 여지가 생겨나게 됨.)

4. Conclusions and Implications(결론 및 시사점)

• In the apportionment of common input tax, even government subsidies that are unrelated to business activities are uniformly regarded as equivalent to tax-exempt supply values. As a result, the VAT burden of taxpayers who engage in both taxable and tax-exempt supplies increases.(공통매입세액 안분 시에는 사업과 관련 없는 국고보조금까지 전액 면세공급가액 등과 동일하게 간주하여 결과적으로 과세공급가액과 면세공급가액이 모두 존재하는 사업자의 부가가치세 부담이 증가하게 됨.)
• The current apportionment rules, which uniformly treat government subsidies as non-taxable supply values and include them in tax-exempt supply values, undermine the internal consistency of the VAT system and exceed the limits of delegated legislation.(국고보조금을 획일적으로 비과세 공급가액으로 간주하여 면세등 공급가액에 포함시키는 현행 공통매입세액 안분 규정은 부가가치세 체계의 내적 일관성을 훼손하며 위임입법의 한계를 일탈하고 있음.)
• Since government subsidies that lack consideration for supply cannot be clearly attributed to either taxable or tax-exempt activities, they should be excluded from the apportionment calculation of common input tax, or alternatively, the EU VAT Directive approach should be adopted to allow taxpayers to choose the method.(공급에 대한 대가성이 없는 국고보조금은 과세사업 또는 면세사업의 귀속이 불분명하므로 공통매입세액 안분계산에서 제외하거나, EU 부가가치세 지침을 수용하여 납세의무자가 선택할 수 있도록 해야 함.)

[Questions(질의)]

1. What are the problems of the current legal framework regarding the treatment of government subsidies as non-taxable and tax-exempt supply values in this study?(연구에서 다루고 있는 국고보조금의 비과세 및 면세공급가액에 대한 현행 법령의 문제점?)

■ Analysis of Legal Issues(법령의 문제점 분석)
Under the current legal framework, government subsidies are treated in the same manner as the supply value of non-taxable and tax-exempt businesses, which has led to ongoing disputes between taxpayers and tax authorities.(현행 법령은 국고보조금을 비과세 및 면세사업의 공급가액과 동일하게 취급하고 있어, 납세자와 과세당국 간의 다툼이 지속되고 있음.)

In particular, there are numerous court decisions holding that government subsidies that do not constitute consideration for services provided by a business cannot be regarded as supply value related to non-taxable activities.(특히, 사업자가 제공하는 용역에 대한 반대급부에 해당하지 않는 국고보조금은 비과세사업 관련 공급가액으로 볼 수 없다는 판결이 다수 존재함.)

However, contrary to the position of the courts, the government amended the Enforcement Decree of the Value-Added Tax Act to require that government subsidies be treated in the same way as the supply value of tax-exempt and non-taxable businesses—regardless of the existence of consideration—and be included in both total supply value and the supply value of tax-exempt businesses.(그러나 정부는 법원의 입장과는 달리, 대가성의 유무와 관계없이 국고보조금을 면세사업 및 비과세사업의 공급가액과 동일하게 간주하여 총공급가액 및 면세사업의 공급가액에 포함시키도록 부가가치세법 시행령을 개정함.) P2.

■ Criticism of the Government’s Response(정부의 대응 비판)
This approach by the government has been criticized as a hasty resolution—based on a treasury-oriented perspective—of the conflicting interpretations between tax authorities and the judiciary regarding government subsidies.(이러한 정부의 대응은 국고보조금의 해석을 둘러싼 과세당국과 법원의 상충된 입장을 국고주의적 관점에서 성급하게 해결하였다는 비판을 받고 있음.)

By treating even government subsidies unrelated to business activities as tax-exempt supply values in the apportionment of common input tax, the system ultimately increases the VAT burden of taxpayers engaged in both taxable and tax-exempt supplies.(공통매입세액 안분 시 사업과 관련 없는 국고보조금까지 전액 면세공급가액 등과 동일하게 간주함으로써, 결과적으로 과세공급가액과 면세공급가액이 모두 존재하는 사업자의 부가가치세 부담이 증가하게 됨.)

This results in a situation where the receipt of government subsidies affects the burden of an indirect tax, which lacks justification from the perspective of tax equity and undermines the original purpose of such subsidies.(이는 국고보조금의 수령 여부가 간접세 부담에 영향을 미치게 되어 조세형평성에 비추어 볼 때 정당성이 부족하고, 국고보조금의 본래 취지를 훼손하게 됨) P25.

In conclusion, the current rules for apportioning common input tax contain significant problems, as they uniformly treat government subsidies as non-taxable supply values and include them in the supply value of tax-exempt businesses.(결론적으로, 현행 공통매입세액 안분 규정은 국고보조금을 획일적으로 비과세 공급가액으로 간주하여 면세 등 공급가액에 포함시키는 방식에서 여러 문제점을 내포하고 있음.)

2. What are the specific characteristics of government subsidies mentioned in the study?(연구에서 언급된 국고보조금의 다양한 성격은 구체적으로 어떤 것들이 있는지?)

Government subsidies can be broadly classified into four types, with each type differing in terms of whether it constitutes consideration.(국고보조금의 다양한 성격은 크게 네 가지 유형으로 나눌 수 있으며, 각 유형별로 대가성이 다르게 판단됨.)

■ Type 1(제1유형): Gratuitous Support(무상 지원)
This type involves comprehensive and direct support provided without any consideration for the actions of the subsidy recipient.(이 유형은 보조금 수혜자의 행위에 대한 반대급부가 없고, 무상으로 포괄적이고 직접적으로 지원하는 경우임.)

For example, general financial assistance or support for the primary-purpose activities of non-profit organizations falls under this category.(예를 들어, 일반적인 재정지원이나 비영리법인의 고유 목적 사업 지원이 해당됨.)
In such cases, there is no consideration(이 경우 대가성이 없다고 볼 수 있음.)

■ Type 2(제2유형): Indirect Support(간접 지원)
In this type, subsidies are granted to a recipient who is also a business operator, while support is indirectly provided to those who receive goods or services.(보조금 수혜자 겸 사업자에게 보조금을 지급하고, 재화 등을 공급받는 자에게는 간접적으로 지원하는 경우임.)

For example, compensation for public service obligations provided to the Korea Railroad Corporation falls under this category.(예를 들어, 한국철도공사의 공익 서비스 보상액이 이에 해당함.)

In this case as well, it is considered that there is no consideration.(이 경우에도 대가성이 없다고 판단됨.)

■ Type 3(제3유형): Specific Financial Support(개별적 재정지원)
This type involves subsidies being paid as a direct and specific consideration to suppliers of goods or services through the subsidy recipient.(이 유형은 보조금 수혜자를 통해 재화나 용역의 공급자에게 개별적이고 직접적인 반대급부로 지급되는 경우임. )

In other words, the subsidy recipient uses the funds to pay those who supply goods or services to them—for example, support for research and development or facility investment.(즉, 보조금 수혜자가 이를 재원으로 하여 자신에게 재화나 용역을 공급하는 자에게 지급하는 경우로, 연구개발 및 시설 투자 지원이 이에 해당함.)

In this case, consideration may exist.(이 경우 대가성이 존재할 수 있음.)

■ Type 4(제4유형): Substantive Consideration Relationship(실질적 대가관계)
In this type, the government or similar entity receives goods or services from a business (supplier), and provides funds under the name of subsidies. However, in substance, these funds serve as consideration for the goods or services received.(국가 등이 사업자(재화․용역의 공급자)로부터 재화나 용역을 공급받으면서, 사업자에게 보조금 명목으로 금원을 지급하지만, 그 실질은 국가 등이 제공받은 재화나 용역의 반대급부에 해당하는 경우임.)

In such cases, there is a substantive consideration relationship, and it can be regarded as having consideration.(이 경우에는 실질적 대가관계가 존재하여 대가성이 있다고 볼 수 있음) P22.

Considering these diverse characteristics, treating government subsidies uniformly as tax-exempt supply values without distinction may undermine the consistency of the VAT system and cause confusion.(이러한 다양한 성격을 고려하지 않고 국고보조금을 일괄적으로 면세공급가액과 동일하게 간주하는 것은 부가가치세 체계의 정합성을 해치고 혼란을 초래할 수 있음.) P26